Palmer est de retour à Los Angeles pour un meeting en lien avec sa prochaine campagne électorale. Un cadavre contenant un virus mortel est découvert et le chantage commence : obéir aux instructions ou le virus sera répandu dans plusieurs villes des États-Unis. Mais certains membres de la CAT ont découvert la menace quelque temps auparavant et ont un plan secret, quoiqu'il soit peu conforme aux directives de leur agence.

Tony (Directeur de la CAT), Jack (Directeur du service de terrain de la CAT) et Gael Ortega, un nouvel agent, mettent tout en œuvre pour arracher le virus des mains des frères Salazar, traficants de drogue mexicains un peu trop ambitieux, et d'un vendeur d'armes ukrainien, Michael Amador.